Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Odf2A3KGV1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Odf2A3KGV1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms