Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gm5640A3KG49 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm5640A3KG49 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm5640A3KG49 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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