Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Atp8b5A3FIN4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Atp8b5A3FIN4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Atp8b5A3FIN4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Atp8b5A3FIN4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Atp8b5A3FIN4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Atp8b5A3FIN4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Atp8b5A3FIN4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atp8b5A3FIN4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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