Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Samt1A2BED8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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