Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scn1aA2APX8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Scn1aA2APX8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Scn1aA2APX8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Scn1aA2APX8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1aA2APX8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Scn1aA2APX8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1aA2APX8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1aA2APX8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Scn1aA2APX8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1aA2APX8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1aA2APX8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Scn1aA2APX8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1aA2APX8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scn1aA2APX8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Scn1aA2APX8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Scn1aA2APX8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Scn1aA2APX8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scn1aA2APX8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Scn1aA2APX8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Scn1aA2APX8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Scn1aA2APX8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1aA2APX8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1aA2APX8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1aA2APX8 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1aA2APX8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1aA2APX8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1aA2APX8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1aA2APX8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1aA2APX8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1aA2APX8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1aA2APX8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1aA2APX8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1aA2APX8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scn1aA2APX8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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