Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam43bA2AM80 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms