Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Frmpd1A2AKB4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Frmpd1A2AKB4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms