Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pramel3A2AHA7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pramel3A2AHA7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms