Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Frmpd4A2AFR3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms