Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Myom3A2ABU4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms