Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprfA2A8L5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms