Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
A0A0U1RNP2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms