Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm4T1NXB5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms