Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Robo3Q9Z2I4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Robo3Q9Z2I4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms