Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mbd3Q9Z2D8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mbd3Q9Z2D8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms