Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms