Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Cldn8Q9Z260 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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Cldn8Q9Z260 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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