Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms