Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lgr5Q9Z1P4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms