Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D9

Znf394, Zinc finger protein 394, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf394Q9Z1D9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znf394Q9Z1D9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms