Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TapbpQ9R233 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TapbpQ9R233 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TapbpQ9R233 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TapbpQ9R233 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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TapbpQ9R233 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TapbpQ9R233 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TapbpQ9R233 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TapbpQ9R233 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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TapbpQ9R233 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TapbpQ9R233 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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