Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Wdr54Q9R0D8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Wdr54Q9R0D8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms