Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lamc3Q9R0B6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lamc3Q9R0B6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms