Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms