Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trpc5Q9QX29 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trpc5Q9QX29 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms