Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chaf1aQ9QWF0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms