Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PdcQ9QW08 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms