Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms