Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SrfQ9JM73 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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