Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rabgef1Q9JM13 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rabgef1Q9JM13 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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