Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Habp4Q9JKS5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms