Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb3Q9JKS4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb3Q9JKS4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms