Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tfcp2Q9ERA0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms