Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Capn12Q9ER56 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms