Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Kcnn1Q9EQR3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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Kcnn1Q9EQR3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Kcnn1Q9EQR3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Kcnn1Q9EQR3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Kcnn1Q9EQR3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Kcnn1Q9EQR3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Kcnn1Q9EQR3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Kcnn1Q9EQR3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnn1Q9EQR3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnn1Q9EQR3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnn1Q9EQR3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnn1Q9EQR3 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Kcnn1Q9EQR3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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