Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPE9

Atp13a1, Manganese-transporting ATPase 13A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a1Q9EPE9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp13a1Q9EPE9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms