Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc97Q9DBT3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms