Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrpraQ9DBG7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SrpraQ9DBG7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms