Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Chmp2aQ9DB34 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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