Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prpf4Q9DAW6 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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