Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ccdc89Q9DA73 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ccdc89Q9DA73 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ccdc89Q9DA73 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ccdc89Q9DA73 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ccdc89Q9DA73 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ccdc89Q9DA73 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ccdc89Q9DA73 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ccdc89Q9DA73 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ccdc89Q9DA73 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc89Q9DA73 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms