Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp12Q9D9M2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp12Q9D9M2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms