Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cnot8Q9D8X5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms