Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gtf3c6Q9D8P7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gtf3c6Q9D8P7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gtf3c6Q9D8P7 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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