Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q9D7E4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q9D7E4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms