Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc94Q9D6J3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms