Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sdr42e1Q9D665 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms