Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt34Q9D646 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt34Q9D646 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms