Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab11fip1Q9D620 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms