Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm3404Q9D506 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms